FUCIO-verkoston jäseniä ovat yliopistojen tietotekniikkatoimintojen ylimmät johtajat. Tällä hetkellä FUCIO-organisaatioita on 14 ja FUCIOn jäseniä 20 henkilöä.
Verkoston jäsenistön kevät- ja syyskokouksissa päätetään yleisistä linjauksista joita työvaliokunta ja IT-pääsihteeri toteuttavat käytännössä.
Verkosto toimii myös asiantuntijoiden SIG-ryhmissä (special interest group). Useat näistä ovat yhteisiä ammattikorkeakoulujen AAPA-verkoston kanssa.
Jotkin yhteistyöryhmät ovat toimineet jo pitkään, kuten tietoturvaan keskittyvä SEC-TV-ryhmä ja arkkitehtuurin KA-SIG.
Kansainvälinen yhteistyö
Yksi FUCIOn tärkeimmistä yhteistyökumppaneista on EUNIS, Euroopan yliopistojen IT-yhteistyöorganisaatio. [ linkki: http://www.eunis.org/ ]
EUNISin alaisuudessa toimii monia alaryhmiä (Task Force) mukaanlukien FUCIOn jo yli kummnenen vuotta sitten alkuun panema BencHEIT Task Force sekä Enterprise Architecture Special Interest Group.[ linkki: www.eunis.org/task-forces/benchmarking ]